Правельность оформления КС2

Нет.
Необходимо передать заказчику формы выполнения составленные согласно договору и сроки в формах должны стоять такие, какие Вам нужны, а не заказчику, то есть согласно реальному проведению работ. Ни каких переносов сроков не писать. Формы передавать Заказчику по сопроводительному письму с описью. В Вашем договоре есть пункт о обоснованном отказе подписания форм заказчиком в четкий срок (наверняка пять рабочих или календарных дней), иначе формы считаются принятыми. Несите формы, не тяните. Если исполнительную документацию не приложите, то получите мотивированный отказ, иначе пусть попробуют придраться. В сопроводительном письме сошлитесь на пункт договора, согласно которому Вы передаёте формы, и пункт договора, согласно которому заказчик обязан подписать формы в договорной срок (5 дней), иначе формы будут считаться принятыми. Приложите все бухгалтерские бумажки, необходимые по договору туда же: КС-3 (с итогом к оплате за вычетом процента аванса, вычета гарантийных), счёт, счёт-фактура. Письмо с сопроводительной описью необходимо зарегистрировать у заказчика, у секретаря поставить на своем экземпляре письма и описи входящую отметку. Можно опись вписать прямо в письме как приложения.
Только так, если заказчик не хочет спокойно, то навязать ему выполнение ЕГО обязательств по договору. СУД будет на Вашей стороне только в том случае, если у Вас есть такие письма с передачей заказчику всех необходимых документов по договору от Вас заказчику.

Дата окончания периода и дата составления могут не совпадать, но:
желательно не увлекаться переходом даты составления с датой окончания периода работ в форме через важные даты налоговых отчетов - Ваша бухгалтерия мозг сломает себе со списанием и налогами, так как налоги надо оплатить по факту выполнения работ, списание по форме так же непонятно когда делать, то есть понятно, но не понятно. Внутри одного квартала легко, но не через годовой отчет. С точки зрения ПТО - пофигу на несовпадения сроков, а с точки зрения собственной бухгалтерии может возникнуть затруднение. Гл.буху скажите, что можно, но нужно так что бы было удобно собственной бухгалтерии. Если Ваш гл.бух разрешит - пишите то что он согласует. Затруднения заказчика Вас не должны волновать, они вам все сроки сорвали, хотя Вы сами виноваты в не подаче форм по письму, поэтому согласование сроков для бухгалтерских отчетов ТОЛЬКО с Вашим гл.бухом и без учета мнения бухгалтерии заказчика.

Если у Вас в отчетном периоде будет стоять период помещающийся в договор, то можно не делать доп.согл. на продление сроков работ. Дата составления формы не имеет прямого отношения к дате окончания периода работ по форме, только косвенное. В Вашем договоре нет (я на 100% уверен) крайней даты подписания и оформления всех бумажек, в договоре фиксируется только дата окончания работ, а в Вашей форме период в рамках сроков по договору. Так что Вы со своей стороны не сорвали сроков выполнения работ - доказательством будет служить подписанная исполнительная документация (в ней есть даты) и форма КС-2 с отчетным периодом по этой ИД, КС-2 сданная по письму и не получившая замечаний, либо нормально подписанная.