Сумма по локальной смете больше выигранной

 182484,54 делите на 183217,57 получаете договорной коэффициент.  

Или можно НДС забрать как компенсацию за материалы и эксплуатацию техники? Только как это посчитать?  

Итого без НДС по смете: 183217,57
Итого с учетом коэффициента тендерного снижения: 183217,57*0,99599913=182484,54
НДС не предусмотрен
Или можно просто указать Итого согласно договору № откакого числа и сумму пишите и все

Какой смысл этот огород городить с компенсацией? Кому она вообще нужна? Заказчику - не нужна, ему без разницы, он должен оплатить Подрядчику цену контракта и все. Заказчику дальше без разницы, что с этими деньгами Подрядчик сделает. Подрядчику? Дак ему вообще фиолетово - он на УСН, не отчитывается он по НДС ни как.

Получается, что самый верный способ сделать:

ИТОГО без НДС
Коэ.тендерного снижения 0,9 - которым вы понижались на торгах
Итого с Коэ.тендерного снижения :
Коэффициент приводящий к цене контракт при УСН подрядчика - это повышающий коэффициент до цены контракта, или понижающий до цены контракта.
ВСЕГО по АКТУ

Что тут еще можно придумать, а главное зачем? Ведь по факту нужно отдать подрядчику эти 20% по любому и какая разница как это сделать? Хоть компенсация + повышающий, хоть просто * на повышающий. Сумма от этого никак не поменяется. Перед проверяющими органами - Заказчик чист, как простынь у священника, все оплатил согласно контракта, Подрядчик вообще НДС не платит... - значит и вопросов нет.  

это еще один вариант как можно сделать, но скажу так, для кого то и эти два коэффициента будут считаться огородом. Были случаи еще по старой методике, со слов заказчика: не надо нам понижающих 0,7 и 0,9 ни НДС соответственно, просто базовая цена - индекс - понижающий или повышающий (т.е. один коэф.) и все