Заказчик просит закрыть эти работы КС-ками.

Проектные работы не закрываются Кс-ками, как правило, составляется Акт приема-передачи проектной документации и на основании него АКТ Сдачи-приемки выполненных работ, унифицированной формы нет, каждый делает такой акт, как ему заблагорасудиться. У меня были и такие Заказчики, для которых мы делали Кс-2 на проектные работы (одной строчкой прописывали "Выполнение проектных работ...." в екселе), кто платит, тот и заказывает музыку.

Многие заказчики требует оформление КС-2 и КС-3 на проектные работы, причем с подтверждением общей суммы по расценкам СБЦ.

Вот еще нашла:
ОАО «ЦЕНТРИНВЕСТпроект» СБОРНИК РАЗЪЯСНЕНИЙ ПО ПРЕДПРОЕКТНОЙ И ПРОЕКТНОЙ ПОДГОТОВКЕ СТРОИТЕЛЬСТВА выпуск 3 2010 г.
Вопрос 27: Применима ли форма акта КС-2 для оформления акта приёмки-сдачи проектно-изыскательских работ?
Ответ:Форма акта на выполнение проектно-изыскательских работ нормативными документами федерального уровня не установлена.
Как указано в письме Управления МНС по г.Москве от 03.10.2003 № 26-12/55341, «Унифицированными формами первичной учётной документации по учёту работ в капитальном строительстве и ремонтно-строительных ра-бот», утвержденными постановлением Госкомстата России от 11.11.99 № 100, определены форма и порядок заполнения справок формы № КС-2 и № КС-3.
Унифицированными формами первичной учетной документации по учету работ по договору на проектно-изыскательские работы является акт сдачи-приёмки работ с приложением к нему комплекта документации, предусмотрен-ной техническим заданием».
Следовательно, акт приёмки-сдачи проектно-изыскательских работ может быть представлен по форме, согласованной сторонами (заказчиком и подрядчи-ком).
Рекомендуемая форма акта приёмки-сдачи научно-технической документа-ции, которая может быть использована для приемки – сдачи проектно-изыскательских работ, дана в Сборнике типовых договоров (Москва, издательство «ИНФА-М», 1997 г., с. 85).
Что касается формы КС-2, то согласно Указаниям по применению и заполне-нию форм, утвержденным постановлением Госкомстата России от 11.11.99 № 100 форма КС-2 применяется «для приёмки выполненных подрядных строи-тельно-монтажных работ производственного, жилищного, гражданского и дру-гих назначений. Акт составляется на основании данных Журнала учёта выпол-ненных работ (форма № КС-6а) в необходимом количестве экземпляров. Акт подписывается уполномоченными представителями сторон, имеющих право подписи (производителя работ и заказчика (генподрядчика)».
Поскольку при выполнении проектно-изыскательских работ ведение журнала данных работ действующими нормативными правовыми актами Российской Федерации не предусмотрено, применение формы КС-2 для оформления акта приемки указанных работ представляется некорректным.