Где отражено, что понижающий коэффициент начисляется до НДС

Все равно получается неверно.

Допустим по смете 100 рублей, НДС -20 рублей = 120руб, понижающий К 0,9= 108 р.
        или по смете 100 руб, понижающий К 0,9= 90 руб, НДС =  18 руб., Итог 108 руб.

Итог один, но НДС то разный.

Света, Чем больше сумма облагается НДС, тем больше математическая погрешность.

Света, У меня по русскому была двойка в школе, а у Вас наверное по математике)))

Света, Посмотрите выполнение. Сумма НДС всегда выделяется от налогооблагаемой базы.
1). 120*0,9=108.  в том числе НДС 108/118*18.
2)100*0,9*=90*1,18=108. Сумма НДС и в том и в том случае будет 18 руб.

ну тогда не указывайте 2 раза НДС, сделайте строчку " Итого СМР в текущих ценах с НДС", и потом строчку "Всего по Акту с учетом коэф. тендерного снижения" и выделите итоговый НДС.