Правильно ли я делаю перевозку в соответствии с приказом 557/пр

почти.
для перевозки грунта вы делаете все правильно.
для перевозки материалов исключаете 30 км правильно, но индекс необходимо брать не на материалы4,58, а на ЭМ 11,1

п. 45 методики 421/прЗатраты на перевозку грузов для строительства автомобильным транспортом, в том числе на дополнительное расстояние сверх учтенного сметными ценами на материальные ресурсы и оборудование, при отсутствии индексов на перевозку, определяются в текущем уровне цен с использованием индекса к СМР, а при его отсутствии - рассчитываемого для применения к сметной стоимости эксплуатации машин и механизмов

При этом, п. 63
Дополнительные затраты на перевозку, а также на погрузо-разгрузочные работы материальных ресурсов в локальных расчетах (сметах) относятся к сметной стоимости материалов

и в отдельный раздел перевозку выделять нельзя. она должна быть подпунктом с определенной нумерацией к материальному ресурсу, который учитываете. Смотрите Приложение 3 к Методике

в строках дополнительной перевозки, учитываемой в соответствии с пунктом 63 Методики, указывается номер, состоящих из двух групп цифр, разделенных точкой, первая группа цифр которых соответствует номеру позиции неучтенного ресурса, к которому относятся затраты на дополнительную перевозку, вторая - порядковому номеру строки дополнительной перевозки в позиции (1 или 2), например, 7.2.1, где 7.2 - номер позиции неучтенного ресурса или оборудования, 1 - порядковый номер строки дополнительной перевозки в позиции.

подскажите, а если идти по схеме: не вычитать 30 км, а добавлять разницу? Ведь в фссц учтено 30 км, следовательно можно взять допом фссцпг на 49 км при расстоянии 79 км?

Доброго дня! а как быть если объект находится в 700 км от цивилизации, и вести туда мы будем все (от гвоздей до крупного оборудования).  ((((Количество смет около 700 на весь объект, позиций в сметах в среднем по 300-400). тут тоже надо учитывать доставку в каждой позиции под всем материалом (даже под расходниками)? мы включили доставку в каждую смету отдельным разделом на все материалы.  

Доброго дня! а как быть если объект находится в 700 км от цивилизации, и вести туда мы будем все (от гвоздей до крупного оборудования).  ((((Количество смет около 700 на весь объект, позиций в сметах в среднем по 300-400). тут тоже надо учитывать доставку в каждой позиции под всем материалом (даже под расходниками)? мы включили доставку в каждую смету отдельным разделом на все материалы.  

«Свежо предание, а верится с трудом»

ГГЭ конечно нет. им же вашу доставку пересчитать/перепроверить надо, кто же с безработицей бороться будет как не они?