Соответствие КС-2 смете к договору

Нет такого документа. Это определяется в договоре. К примеру, прописывается, что окончательная стоимость по договору, может быть изменена в случае изменения кол-ва и/или видов работ. Это бывает когда, по каким-то причинам, невозможно определить что и за сколько в конце-концовов, будет делать подрядчик. Это сплошь и рядом происходит. В целом это ни чему не противоречит. НДС вы закрываете с выполнения, т.е претензий от налоговой не будет. Да и что не мешает, с последним закрытием, приложить исполнительную смету, со всеми закрытыми ранее объёмами. Сто раз так делал, за многолетнюю работу в структуре ГП.