При применении автовышек убираются ли из строительных работ краны

Нормативными документами...например Методика применения сметных норм, утвержденная Приказом Минстроя от 29.12.2016 г №1028
п. 3.4. Сметные нормы разработаны на основе принципа усреднения и минимизацией расходов всех необходимых ресурсов и в сторону уменьшения не корректируются...
п.5.3.
Сметные нормы корректировке не подлежат, в том числе, когда проектной документацией предусмотрено:
- использование строительных машин и механизмов, не учтенных в сметных нормах, не меняющих принципиально технологические и организационные схемы производства работ;
- использование в соответствии с ПОС машин и механизмов, технические характеристики которых отличаются от учтенных сметными нормами, но при этом принципиально не меняются технологические и организационные схемы производства работ....

Ну и так далее...

Ольга, печально. Тогда придется Вам слушать заказчика

Рахим Рахимов, посмотрите ответ № 2. Какой бы бульдозер не применяли по факту, учитывается тот, который в составе расценки, т.к. расценки не корректируются.  

В расценки присутствуют абстрактные механизмы, так как расценки носят усреднённый характер. Да заказчик с одной стороны прав, но Вы в любом случае применили автовышку, и заказчик стоимость работы автовышки обязан оплатить, так как Вы понесли затраты и естественно без автовышки Вы физически не можете выполнить данную работу. А как будет оформлены затраты по  автовышки, в КС-2 или справкой о применённых механизмов это уже следующей вопрос. В любом случае затраты заказчик должен компенсировать.